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脚之间。黑质不是一个均一的核团，它可分为结构和功能上都相差很大的黑质致密部，黑质网状部和黑质侧部三部分。它是有关基底核间互相连络之重要构造。黑质致密部的神经元含有黑色素。所以在脑切片中，这些神经原呈现黑色。这是名称“黑质”的由来。这些神经元有长且粗的树突，腹侧树突很多投射到黑质网状部。在黑质致密部以外的中脑还弥散分布有很多类似的神经元。所有这些含黑色素的神经元通过黑质纹状体通路投射到纹状体，输送一种称为多巴胺的神经递质。除此，黑质的神经元也投射到其他基底核的核团，包括苍白球，黑质致密部和丘脑下核。 黑质致密部的神经元接受来自网状部的轴突的侧枝输入。这些输入是抑制性的。